• 康亚妮

    博士,高级工程师,硕士生导师,晨星青年学者、卓越奖励计划获得者。主要从事基因检测与疾病诊断新技术的研发及应用工作,建立了多种基于高通量测序的表观基因组、转录组学技术,并将其应用于肿瘤、干细胞、卵巢疾病的检测及其发生机制的研究。发表学术论文50余篇,发明专利20余项,论著2篇。研究成果获抗癌协会颁发的杰出贡献奖、肿瘤国际会议Travel Award及蒙民伟国际交流基金的资助。负责上海市自然科学基金、转化医学基金、医工交叉研究课题、实验室科技创新课题等科研项目。指导百余名本科生的毕业设计、大创、PRP、科创实践等项目50多项,获多项科技创新竞赛奖。中国生物工程学会系统生物医学专业委员会、中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会会员。



研究方向


1.   基因检测与疾病诊断新技术的研发

2.   肿瘤液体活检及甲基化诊断试剂盒的开发

3.   疾病发生发展的表观基因组和转录调控机制

4.   DNA甲基化与衰老标志物:表观遗传时钟

5.   单细胞甲基化



科研项目

项目来源/类型

课题名称

角色

上海市自然科学基金 技术探索类项目

血浆cfDNA全局性甲基化检测技术的研发及应用

负责人

转化医学国家重大科技基础设施开放课题

肿瘤血浆cfDNA全基因组甲基化检测技术的研发及应用

bat365在线平台登录决策咨询课题实验技术专项

一种高分辨率的全基因组范围APA位点定位分析方法的研究

bat365在线平台登录决策咨询课题实验技术专项

肿瘤血浆cfDNA全基因组甲基化检测技术

bat365在线平台登录实验室创新研究项目

基于高通量测序的全基因组范围分析APA的技术研发

SMC-晨星优秀青年学者奖励计划

胃癌发生发展的表观遗传调控机制

产学研校企合作项目

胰腺癌病人血液cfDNA甲基化谱分析

“交大之星”医工交叉研究基金

microRNA-21调控肺癌细胞上皮-间质转化与转移潜能的研究

合作方

负责人

“交大之星”医工交叉研究基金

食道通结方联合化疗治疗食管癌的血液脂质代谢组学研究

“交大之星”医工交叉研究基金

Hh-ABCG2信号通路促进胃癌化疗耐药的作用机制研究

医工交叉研究基金

基于3T-seq的复发胶质瘤选择性多聚腺苷酸化(APA)位点的研究

医工交叉研究基金

神经胶质瘤间充质型肿瘤干细胞放疗抵抗的分子机制

国家自然科学基金面上项目

MOV10蛋白抑制逆转录转座子LINE-1转座的机理研究

国家自然科学基金面上项目

水杨酸和茉莉酸甲酯对高温胁迫龙须菜的作用及其机理研究

医工交叉项目已结题5项(结项评价2项优秀、3项良好),合作经验较丰富。

如对相关研究方向感兴趣,欢迎交流、合作,共同开展医工交叉、校企合作等项目。

代表性论文专著


1.     He M, Zhang H, Zhang Y, Ding Y, Zhang F, Kang Y*. Systematic Analysis to Identify the MIR99AHG-has-miR-21-5p-EHD1 CeRNA Regulatory Network as Potential Biomarkers in Lung Cancer. J Cancer. 2024 Mar 4;15(8):2391-2402.

2.     Zhang F, Ding Y, Zhang B, He M, Wang Z, Lu C, Kang Y*. Analysis of Methylome, Transcriptome, and Lipid Metabolites to Understand the Molecular Abnormalities in Polycystic Ovary Syndrome. Diabetes Metab Syndr Obes. 2023 Sep 11;16:2745-2763.

3.     Gao QH, Wen B, Kang Y*, Zhang WM*. Pump-free microfluidic magnetic levitation approach for density-based cell characterization. Biosens Bioelectron. 2022 May 15; 204:114052. 

4.     Zhao H, Zhang H, Xu W, Wen B, Kang Y*. A Sight of the Diagnostic Value of Aberrant Cell-Free DNA Methylation in Lung Cancer. Dis Markers. 2022 Jan 27;2022:9619357. 

5.     Yu B, Zhu N, Fan Z, Li J, Kang Y*, Liu B*. miR-29c inhibits metastasis of gastric cancer cells by targeting VEGFA. J Cancer. 2022 Otc 31; 13(14):3566-3574. 

6.     Mao Z, Li T, Zhao H, Wang X, Kang Y, Kang Y*. Methylome and transcriptome profiling revealed epigenetic silencing of LPCAT1 and PCYT1A associated with lipidome alterations in polycystic ovary syndrome. J Cell Physiol. 2021;236:6362-6375. 

7.     Mao Z, Li T, Zhao H, Qin Y, Wang X, Kang Y*. Identification of epigenetic interactions between microRNA and DNA methylation associated with polycystic ovarian syndrome. J Hum Genet. 2021,66(2):123-137.  

8.     Qin Y, Li T, Zhao H, Mao Z, Ding C, Kang Y*. Integrated Transcriptomic and Epigenetic Study of PCOS: Impact of Map3k1 and Map1lc3a Promoter Methylation on Autophagy. Front. Genet. 2021,12:620241.

9.     Qin Y, Wang Y, Zhao H, Yang Z, Kang Y*. Aberrant miRNA-mRNA regulatory network in polycystic ovary syndrome is associated with markers of insulin sensitivity and inflammation. Ann Transl Med.2021;9(18):1405.

10.  Mao Z, Zhao H, Qin Y, Wei J, Sun J, Zhang W, Kang Y*. Post-Transcriptional Dysregulation of microRNA and Alternative Polyadenylation in Colorectal Cancer. Frontiers in Genetics. 2020, 11:64.

11.  Wei J , Gao X, Qin Y, Liu T, Kang Y*. An iron metabolism-related SLC22A17 for the prognostic value of gastric cancer. OncoTargets and Therapy, 2020:13 12763-75.

12.  Kang Y, Ooi HS, Zhao X. Transcript Profiling Analysis Through Paired-End Ditag (PET) Approach Coupled with Deep Sequencing Reveals Transcriptome Complexity in Yeast. Methods Mol Biol. 2019;2049:105-112.

13.  Xu W, Lu J, Zhao Q, Wu J, Sun J, Han B, Zhao X, Kang Y*. Genome-Wide Plasma Cell-Free DNA Methylation Profiling Identifies Potential Biomarkers for Lung Cancer. Dis Markers. 2019 Feb 5;2019:4108474.

14.  Yang X, Wu J, Xu W, Tan S, Chen C, Wang X, Sun J, Kang Y*. Genome-wide profiling reveals cancer-related genes with switched alternative polyadenylation sites in colorectal cancer. Onco Targets Ther. 2018 Aug 31;11:5349-5357.

15.  Kang Y, Wang ZJ, Xie D, Sun X, Yang W, Zhao X, Xu N. Characterization and Potential Antitumor Activity of Polysaccharide from Gracilariopsis lemaneiformis. Mar Drugs. 2017 Mar 29;15(4):100.


教学工作

课程:

《毕业设计(论文)生物医学工程》;《科技创新与实习》;《分子病理学》

高中生课题指导:学森挑战科创营、夏令营、冬令营科创讲座、课题探究、竞赛指导


研究生培养/招生专业:

生物学、生物与医药、生物医学工程(欢迎咨询、报考)

软件版权登记及专利

授权发明专利:

专利名称

授权专利号

授权日期

发明人

一种用于肺癌预后诊断标志物的应用及检测试剂盒

CN113151462B

2023.3.21

康亚妮,何梦菊,张浩然,张辉,徐菡佳,丁羽殷

诊断结直肠癌的分子组合标志物及检测试剂盒

CN110241211B

2023.3.28

康亚妮,毛湛睿,孙洁林,张辉,赵晖

一种可传代细胞的高保真甲基化位点的分离与分析方法

CN115651973B

2023.9.29

康亚妮,程酩,王佳宁,邵志峰,李华,秦玉兰

一种精准分析单细胞APA位点的sc3T-seq方法

CN116083531B

2023.5.9

康亚妮,文柏清,张伟伟,张飞,何梦菊,张博涵

一种用于生物大组织X射线3D高分辨率成像的标记方法

CN116106540B

2023.5.12

邵志峰,文柏清,张倪,闫方,李小卫,孙洁林,康亚妮,程酩

一种从卵泡液中提取cfDNA的方法

CN110144345B

2022.7.15

康亚妮,秦玉兰,毛湛睿,赵晖

一种检测蛋白质和DNA相互作用的试剂盒与方法及应用

CN108680757B

2021.2.9

康亚妮,赵小东,徐伟,毛湛睿

一种用于DNA甲基化检测的试剂盒与方法及应用

CN108796039B

2021.10.8

康亚妮,赵小东,邵志峰,毛湛睿,金戈旋

一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术

CN109023537B

2021.10.8

赵小东,康亚妮,胡丛霞,徐伟

红藻龙须菜多糖及其制备、抗肿瘤活性检测方法和应用

CN105542024B

2018.11.20

康亚妮,赵小东,邵志峰

基于3T-seq全基因组范围分析APA的方法

CN103911449B

2015.08.12

赵小东,邵志峰,康亚妮,赖登攀,吴俊

荣誉奖励

国际肿瘤会议优秀海报奖(Outstanding Contribution and Poster Award)

bat365在线平台登录卓越奖励计划

bat365在线平台登录SMC晨星青年学者优秀教师奖励计划

bat365在线平台登录实验室安全与环保督导专家

bat365在线平台登录优秀班主任
中国生物工程学会 系统生物医学专业委员会会员
中国抗癌协会 肿瘤标志专业委员会会员


指导学生科创竞赛获奖:

国家级大学生生命科学创新竞赛 二等奖

上海市大学生生命科学创新竞赛 一等奖

bat365在线平台登录大学生生命科学创新竞赛 获奖7项

bat365在线平台登录“钱学森杯”科创竞赛 获奖5项

bat365在线平台登录首届毕业设计作品展 一等奖

指导中学生、小学生科创课题及竞赛项目多项

联系方式

邮箱地址:kangyani@sjtu.edu.cn

办公地址:闵行校区文选医学楼126